Глобальная инициатива определяет ключи, которые могут открыть более индивидуализированные методы лечения рака

Ключи идентификаторов глобальной инициативы, которые могут разблокировать более персонализированные методы лечения рака
Международная инициатива по неоантигенам Альянс по отбору опухолевых неоантигенов (TESLA) определяет параметры для улучшения противораковой вакцины или клеточной терапии. Фото: Институт иммунотерапии рака Паркера

Неоантигены, крошечные маркеры, возникающие в результате мутаций рака, помечают клетки как злокачественные и могут стать ключом к открытию нового поколения иммунотерапевтических средств. Нацеливание на «правильные» неоантигены — в вакцине против рака или клеточной терапии — обещает устранить рак пациента с минимальными побочными эффектами. Но в опухоли могут существовать сотни мутаций, и только некоторые из них могут вызывать неоантигены, которые могут вызвать иммунный ответ против рака. Вопрос в том, какие?

Ученые из инициативы, запущенной Институтом иммунотерапии рака (PICI) и Институтом исследований рака под названием Tumor Neoantigen Selection Alliance (TESLA), обнаружили параметры, позволяющие точнее предсказать, какие неоантигены могут стимулировать эффект уничтожения рака. TESLA объединяет 36 ведущих исследовательских групп в области биотехнологий, фармацевтики, университетов и научных некоммерческих организаций. Их результаты были опубликованы сегодня в Интернете в Cell и могут породить новое поколение более эффективных, персонализированных иммунотерапевтических методов лечения рака.

С помощью расширенного компьютерного анализа альянс обнаружил пять характеристик, которые четко указывают, какие маркеры рака с наибольшей вероятностью вызывают иммунный ответ. Они подразделяются на две основные категории: способ представления неоантигена в раковой клетке и способ распознавания неоантигена иммунной системой.

Когда модель данных, подчеркивающая эти пять характеристик, была проверена на другом наборе образцов рака, она точно предсказала 75 процентов эффективных целевых неоантигенов и отфильтровала 98 процентов неэффективных.

«Наша цель состоит в том, чтобы данные, полученные с помощью TESLA, стали эталоном при разработке нового лечения на основе неоантигенов», — сказал Дэниел Уэллс, доктор философии, главный специалист по анализу данных PICI и автор исследования. «Если бы каждый метод, старый и новый, использовал данные для сравнения своих прогнозов, все поле могло бы сотрудничать и использовать новые методы гораздо быстрее».

Уэллс был одним из руководителей TESLA с Надин Дефрану, доктором философии, соавтором статьи.

Инициатива, возглавляемая Институтом иммунотерапии рака и Научно-исследовательским институтом рака, обнаруживает ключи, которые могут открыть ключи, которые могут открыть более индивидуализированные методы лечения для уничтожения рака Авторы и права: Институт иммунотерапии рака Паркера

Для создания этого эталонного теста каждая команда TESLA представила свои наиболее многообещающие прогнозы по неоантигенам для ткани меланомы и немелкоклеточного рака легкого (НМРЛ) открытой научной некоммерческой организации Sage Bionetworks. Затем PICI сравнил и подтвердил, какие прогнозы были правильными и распознаваемыми Т-клеткой.

Когда пять вновь обнаруженных характеристик были повторно применены к алгоритмам участвующих команд, прогнозы заметно улучшились.

«До сих пор прогнозирование неоантигенов было черным ящиком. У нас были намеки на то, какие функции могут быть важными. Модель данных TESLA является первой, которая идентифицировала эти пять функций как значимые», — сказал известный эксперт по неоантигенам, соавтор. старший автор статьи и профессор Роберт Д. Шрайбер, доктор философии, директор Центра иммунологии человека и иммунотерапии Эндрю М. и Джейн М. Бурски при Медицинской школе Вашингтонского университета в Сент-Луисе.

Результаты также показали, что нет двух одинаковых методик прогнозирования, а большинство из них существенно различаются. Ни одна из методик команды не идентифицировала каждый неоантиген или подавляющее большинство этих маркеров рака, что указывает на необходимость согласованных научных усилий, таких как TESLA.

Необходимы дальнейшие исследования в отношении других типов рака, но эти открытия являются значительным шагом вперед в исследованиях неоантигенов.

«Это исследование может улучшить математические алгоритмы производителей лекарств и исследователей. Оно может определить приоритет антигенов, которые, скорее всего, присутствуют в раке каждого пациента и наиболее заметны для иммунной системы, и при этом снизить приоритетность тех, которых нет. означает более индивидуальный подход к лечению пациентов «, — сказала Лиза Баттерфилд, доктор философии, вице-президент по исследованиям и разработкам PICI. «Мы очень рады видеть, в какой области можно найти эти результаты».

Полный набор данных TESLA, самый крупный в своем роде, доступен исследовательскому сообществу бесплатно. Есть надежда, что это может привести к ускоренному развитию персонализированной терапии и даже повышению эффективности для онкологических больных во всем мире.

Spread the love